El elegir ciertos Pokémon para que sean exclusivos de una
edición de tal manera que a la otra le sea imposible conseguirlos sin
intercambio, ya es costumbre en los juegos Pokémon al estilo RPG, Pokémon Mundo
Misterioso no es la excepción puesto que en sus dos ediciones distintas: Equipo
de Rescate Azul para el Nintendo DS y Equipo de Rescate Rojo para la GameBoy
Advance utiliza el mismo mecanismo.

Imagen

Pokémon exclusivos de Pokémon Mundo
Misterioso Equipo de Rescate Azul
Imagen
Magikarp
Imagen
Gyarados
Imagen
Lapras
Imagen
Aipom
Imagen
Porygon2
Imagen
Minum

Imagen

Pokémon exclusivos de Pokémon Mundo
Misterioso Equipo de Rescate Rojo
Imagen
Porygon
Imagen
Mantine
Imagen
Feebas
Imagen
Milotic
Imagen
Roselia
Imagen
Plusle

El número de Pokémon exclusivos de cada edición es un poco ridículo puesto
que solo son 6 Pokémon que no se podrán obtener de 386.