Aquí los lugares de Puzzle Village y que se puede hacer en cada uno.

Estadio de 1 Jugador ( 1p Stadium)
Este estadio es para batallar contra la liga Pokémon y la Elite 4, posee 5 niveles, primero estarán Fácil, Normal y Difícil, una vez terminado el difícil, se te otorgara un truco para liberar el Muy Difícil y terminado este el código para Super Difícil. Una vez que termines todos los niveles se te otorgara un Truco para poder jugar con la Elite 4 en el modo de 2 jugadores.

Los entrenadores que tendrás que combatir son los siguientes. Por cada vez que termines una dificultad en la siguiente aparecerán mas oponentes.

Modo Fácil: Tendrás que combatir contra 11 entrenadores.
1 – Gary: Nidoran – Growlithe – Craby
2 – Brock: Geodude – Vulpix – Zubat
3 – Misty: Horsea – Psyduck – Staryu
4 – Lt. Surge: Raichu – Jolteon – Magnetone
5 – Erika: Tangela – Weepinbell – Gloom
6 – Koga: Venomoth – Voltorb – Golbat
7 – Sabrina: Abra – Hipno – Alakazam
8 – Blaine: Arcanine – Charmeleon – Magmar
9 – Tracey: Marill – Venonath – Scyther
10 – Team Rocket : Weezing - Arbok – Golbat
11 – Geovanni: Persian – Sandslash – Nidoking

Modo Normal: Se agregan 3 oponentes más los anteriores
12 – Richy: Sparjy – Zipo – Happy
13 – Lorelei: Cloyster – Poliworl – Dewgong
14 – Bruno: Onix – Hitmonchan – Primeape

Modo Difícil: Se agrega un solo entrenador, una vez lo derrotes se te otorgara la Copa del Maestro.
15 – Gary: Nidoqueen – Arcanine – Kingler

Modo Muy Difícil: Una vez terminados el modo Fácil, Normal y Difícil, aparecerán los Créditos y detrás de estos aparecerá un cartel indicándote de que ya puedes desbloquear el Modo Muy Difícil, para hacerlo ve a la pantalla en donde eliges la dificultad y mientras presionas Z presiona L + L + A + B. Si lo hiciste correctamente aparecerá el Modo Muy Difícil. Se agregara el oponente más difícil del juego:
16 – Mewtwo: Pikachu – Squirtle – Bulbasaur.

Modo Súper Difícil: Una vez terminado las 4 dificultades anteriores aparecerá un cartel indicando que si mantienes presionado Z y luego presionas L+R+A+B en la pantalla de dificultades aparecerá el Modo Súper Difícil. No se agregara ningún personaje nuevo, por lo cual el final es contra Mewtwo.

Estadio de 2 Jugadores (2p Stadium)
Aquí solamente podrás entrar si tienes dos mandos insertados para jugar contra un amigo. Podrás elegir la velocidad del juego, pantalla 2D o 3D y que personaje usaras. Para poder usar a Geovanni, Richy, Lorelei y Bruno los dos controles deben presionar Z+L+R. Para jugar en el estadio de Mewtwo tienes que terminar el Estadio de 1 Jugador y escribir Bulbasaur con los controles presionando: B + Arriba + L + B + A + Start + A + Arriba + R. De esta manera el primer jugador será Ash y el segundo Mewtwo.
De esta manera los desbloquearas.

Servicio de SPA (SPA Service)
En este lugar tendrás que superar los desafíos del Equipo Rocket, El juego consiste en sacar todos los bloques posibles hasta que aparezca una línea blanca titilante y los bloques estén debajo de esta. Son casi 50 escenarios y si tienes mucha suerte aparecerá un nivel de Bonus con Buch y Cassidi en el cual debes hacer todas las combinaciones posibles hasta vaciar una línea. Al final tendrás que hacer un nivel parecido al bonus pero contra Giovanni y si le ganas te entregara la llave de Ciudad Rompecabezas. Como los bloques van subiendo mas rápido en cada nivel, realiza una combinación en cadena o de mas de 3 bloques para que Jigglypuff cante y los bloques se detengan unos segundos.

Universidad Rompecabezas (Puzzle University)
Este lugar consta de 3 clases, en cada una de ellas tendrás varios desafíos: para superar cada uno tendrás un máximo de movimientos (no más de 3) y con estos tendrás que eliminar todos los bloques que aparecen en pantalla, si terminas una clase se desbloqueara la otra y te entregaran un titulo.

Zona de Tiempo (Time Zone)
En esta parte debes aguantar todo el tiempo posible y luego volver a jugarlo para pasar tu propio record.

Maratón (Marathon)
Es un juego infinito, se juega hasta que pierdas.

Mansión de Mímica:
Hay te recibirá Tracey, es un modo de practica para que puedas aprender a jugar.

Centro Pokémon (Pokémon Center)
En este lugar podrás ver los records, los perfiles de los personajes del juego, las opciones del juego y las opciones de sonido.
En los records aparecerán las medallas que tienes, el tiempo n Maratón, el tiempo en la Zona de Tiempo, si tienes la llave que se te otorga en el Servicio de Spa y la tu clase de la Universidad Rompecabezas.

Laboratorio del Profesor Oak (Oak´s Lab)
Aquí aparecerán los controles y te enseñara lo básico para jugar, para jugar contra un oponente y las reglas en modo 3D.