En las ediciones Rubí/Zafiro, Rojo Fuego, Verde Hoja y Esmeralda, Deoxys tenia una forma distinta y exclusiva, y al ser transferido a otra perdía la forma que tenia en el juego original, pues bien, en Pokémon Diamante y Perla podremos hacer que nuestro Deoxys adquiera la forma que nosotros deseemos cuantas veces lo queramos.

En Ciudad Rocavelo será donde podremos cambiar la forma de Deoxys. En el esta de la ciudad nos encontraremos con cuatro meteoritos, con los cuales deberemos interactuar (como si habláramos con un personaje) para que nuestro Deoxys en el equipo Pokémon asuma una de las siguientes mutaciones:

Mutación	Sprite Frente	Sprite Espalda	Meteorito
Normal			Medio
Ataque			Abajo, Derecha
Defensa			Abajo, Izquierda
Velocidad			Arriba

Todas las formas de Deoxys tienen distintos estadísticas y aprenden distintos ataques, por lo tanto, al tener la posibilidad de cambiar la forma todas las veces que queramos podremos armar una gran estrategia con este virus. Aquí una tabla de los ataques que aprende Deoxys en sus distintas formas.

Nivel	Ataques
	Normal	Ataque	Defensa	Velocidad
-	Malicioso	Malicioso	Malicioso	Malicioso
-	Repetición	Repetición	Repetición	Repetición
9	Tinieblas	Tinieblas	Tinieblas	Tinieblas
17	Teletransporte	Teletransporte	Teletransporte	Doble Equipo
25	Desarme	Mofa	Desarme	Desarme
33	Persecución	Persecucción	Púas	Persecución
41	Psíquico	Psíquico	Psíquico	Psíquico
49	Robo	Fuerza bruta	Robo	Rapidez
57	Psicocambio	Psicocambio	Psicocambio	Psicocambio
65	Cabezazo Zen	Cabezazo Zen	Cabezazo Zen	Cabezazo Zen
73	Masa cósmica	Masa cósmica	Def. férrea	Agilidad
			Amnesia
81	Recuperación	Electrocañón	Recuperación	Recuperación
89	Psicoataque	Psicoataque	Psicoataque	Psicoataque
97	Hiperrayo	Hiperrayo	Contador	Vel. Extrema
			Manto espejo