Al igual que en juegos anteriores, Pokémon Edición Perla y Diamante incluye la Torre Batalla; un lugar diseñado exclusivamente para batallas Pokémon, donde deberemos enfrentar a entrenadores y Pokémon de excelente nivel, ya sean controlados por la máquina o humanos. En Sinnoh la Torre Batalla se encuentra dentro del Parque Batalla (Battle Park).

Comúnmente estas torres las relacionamos con Pokémon de alto nivel, sin embargo solo podremos participar con tres Pokémon de nivel 50 que no sea ninguno de estos legendarios:
 

#	Sprite	Nombre	Tipo
150		Mewtwo
151		Mew
249		Lugia
250		Ho-oh
251		Celebi
382		Kyogre
383		Groudon
384		Rayquaza
385		Jirachi
386		Deoxys
483		Dialga
484		Palkia
487		Giratina
489		Phione
490		Manaphy
491		Darkrai
492		Shaymin
493		Arceus

De manera similar a la Torre de Batalla de Pokémon Edición Esmeralda, al obtener victorias en este complejo te harás acreedor de preciados Puntos de Batalla (Battle Points), que podrás intercambiar por objetos en la tienda cercana a la torre.

Al ingresar a la Torre Batalla, la recepción se encuentra dividida en tres partes. Cada una de ellas simboliza un modo de juego diferente. Los mismos se titulan Modo Simple (Standar Battle), Modo Múltiple (Multibattle) y un área WiFi.

A continuación comentaremos brevemente los dos primeros modos de batalla:

Modo Simple

En este modo enfrentaremos a la máquina en combates individuales o dobles, que cada vez serán mas duros. Para acceder a el debemos hablar con la recepcionista del centro en la Torre Batalla, para esta modalidad tendremos que registrar a 3 Pokémon en Combate Individual, mientras que en Combate Doble, deberás registrar a 4. Al igual que en Esmeralda nuestros triunfos valdrán la pena ya que ganaremos Puntos de Batalla.

Luego de superar exitosamente el desafío en varias oportunidades impresionaremos al Amo Torre Jericor (Tower Tycoon Palmer), quien deseará desafiarnos a un combate, al aceptar se presentará, te dirá que es el padre de tu rival y te pedirá que le muestres tus habilidades en combate.

Cabe este entrenador es el oponente más duro con quien nos enfrentaremos. Si obtienes la victoria frente a este oponente se te acreditarán 20 Puntos de Batalla.

A continuación se detallan el número de triunfos a obtener y la alineación de Pokémon del entrenador:

Entrenador	Equipo Pokémon
Tower Tycoon Palmer Amo Torre Jericor	21 Triunfos Consecutivos			49 Triunfos Consecutivos
	Dragonite	Milotic	Roserade	Heatran	Regigigas	Cresselia

Modo Múltiple

Para acceder al Modo Múltiple debemos hablar con la recepcionista de la izquierda en la Torre Batalla. En esta sala jugaremos junto a amigos mediante la conexión inalámbrica del Nintendo DS. Aquí debemos aliarnos con otro entrenador para ir superando los desafíos de manera cooperativa.

Si no cuentas con un compañero que pueda acompañarte, este modo también puede ser utilizado.   Lo que deberás hacer es seleccionar uno de los cinco entrenadores controlados por el juego que te estarán esperando en un gran salón. De cualquier forma (ya sea con compañero vía Wi-Fi o elegido del juego) tendremos que registrar a 2 Pokémon.

Cada uno de estos entrenadores cuenta con su equipo Pokémon y estrategias particulares. Probablemente recordarás a estos entrenadores, que ya hicieron equipo contigo durante el desarrollo de la aventura para ayudarte a superar un obstáculo en particular.

A continuación se incluye un listado de los entrenadores disponibles, junto a su equipo Pokémon:

Cheryl / Malta	Posibles Pokémon
Bosque Vetusto	Snorlax	Espeon	Umbreon	Porygon2	Blissey	Milotic
	Latias	Latios	Gastrodon	Porygon-Z	Cresselia	-

 

Cheryl / Mira	Posibles Pokémon
Wayward Cave Cueva Extravío	Alakazam	Gengar	Zapdos	Espeon	Gardevoir	Latios
	Roserade	Magnezone	Magmortar	Togekiss	Glaceon	Porygon-Z

Riley / Quinoa	Posibles Pokémon
Iron Island Isla Hierro	Poliwrath	Machamp	Rhydon	Gyarados	Heracross	Ursaring
	Tyranitar	Blaziken	Breloom	Slaking	Hariyama	Medicham
	Absol	Salamance	Metagross	Infernape	Rampardos	Lucario
	Toxicroak	Rhyperior	Mamoswine	Regigigas	-	-

Marley / Sémola	Posibles Pokémon
Victory Road Camino Victoria	Dugtrio	Electrode	Starmie	Aerodactyl	Crobar	Sceptile
	Swellow	Ninjask	Weavile	-	-	-

Buck / Bulugar	Posibles Pokémon
Hard Montain Montaña Dura	Umbreon	Forretress	Steelix	Shuckle	Skarmory	Regirock
	Regice	Registeel	Bastiodon	Rhyperior	Probopass	Dusknoir
	Cresselia	-	-	-	-	-

Modo Wi-Fi

Mediante este Modo te será permitido establecer combates contra otras personas vía Wi-Fi, los combates podrán ser Individuales o Dobles como las otras modalidades, dependiendo de las victorias acumuladas en esta modalidad, cabe la posibilidad de convertirse en líder de la sala.